Module dcg_sci_tool.structures_analysis.detect_O2_molecules

Functions

def detect_O2_molecules(data, type_names_order)

识别输入帧的O2分子，输出输入帧中O2分子数量、O2的O原子序号列表、O2分子列表。 考虑了周期性边界条件。

Args

data : DataCollection

结构的ovito数据集合

type_names_order : list

原子类型名称列表，索引对应原子类型编号

Returns

tuple

O2分子信息

O2_amount (int): O2分子数量

O2_indexes (list): O2分子中O原子的序号列表

o2_molecules (list): O2分子列表，每个元素是一个元组，包含两个O原子的序号