Module dcg_sci_tool.structures_analysis.color_atoms_in_trajectory_ase

Functions

def color_atoms_in_trajectory_ase(trajectory_file: str,
highlight_color: list,
atom_indices: list,
output_file: str = None) ‑> None

为轨迹文件中的指定原子标记颜色

Args

trajectory_file

输入轨迹文件路径

highlight_color

高亮颜色的RGB值 [R, G, B]

atom_indices

要高亮显示的原子索引列表

output_file

输出文件路径，默认为输入文件名加 '_colored' 后缀