Module dcg_sci_tool.reaction.find_nearest_hollow_site

Functions

def find_nearest_hollow_site(data: ovito.data.DataCollection,
type_names_order: list,
oc_index1: int,
oc_index2: int,
bonded_mode=True) ‑> pyparsing.core.Dict

找到距离1号OC原子和2号OC原子中点最近的hollow位点 若bonded_mode为True，则只考虑与oc_index1/2成键的金属原子，否则考虑邻近所有金属原子

Args

data : DataCollection

结构的ovito数据集合

type_names_order : list

原子类型名称列表，索引对应原子类型编号

oc_index1 : int

目标1号OC原子索引

oc_index2 : int

目标2号OC原子索引

bonded_mode : bool

是否只考虑与oc_index1/2原子成键的金属原子，默认True

Returns

tuple: nearest_hollow_indexes (list): 最近的Hollow位点对应的金属原子序号列表（长度为3）

nearby_hollow_sites_count (int): 1号OC原子和2号OC原子中点附近合理的Hollow位点数量