Module dcg_sci_tool.reaction.find_and_preprocess_input

Functions

def find_and_preprocess_input(mode: str = 'oxidation')

自动截取MD轨迹，查找并预处理输入文件

Args

mode : str

反应模式，'oxidation'或'dissociation'

Returns

cleaned_atoms (ase.Atoms): 清理气体分子后的原子结构 target_atom_list (list): 预处理后的目标原子列表 md_snapshot_file (str): MD 快照文件路径 molecule_indexes (list): CO2生成或O2离解的序号列表（非原子序号）