Module dcg_sci_tool.structures_analysis.detect_CO_CO2_molecules

Functions

def detect_CO_CO2_molecules(data, type_names_order)

识别输入帧中的CO和CO2分子，返回输入帧中CO和CO2分子的数量，以及构成CO和CO2分子的原子序号列表。 考虑了周期性边界条件。

Args

data : DataCollection

结构的ovito数据集合

type_names_order : list

原子类型名称列表，索引对应原子类型编号

Returns

tuple

CO和CO2分子信息

CO_amount (int): CO分子数量

CO2_amount (int): CO2分子数量

CO_atoms_indexes (list): CO分子中所有原子的序号列表

CO2_atoms_indexes (list): CO2分子中所有原子的序号列表

co_molecules (list): CO分子列表，每个元素是一个元组，包含C原子序号和O原子序号

co2_molecules (list): CO2分子列表，每个元素是一个元组，包含C原子序号和两个O原子序号