Module dcg_sci_tool.reaction.find_and_preprocess_input_no_ads

Functions

def find_and_preprocess_input_no_ads()

对于计算没有其他吸附物存在时，在自动截取MD轨迹的算能垒的自动化流程中，查找并预处理输入文件 包括查找neb优化轨迹文件，删除反应中心附近一定范围内的吸附物，保存清理后的结构轨迹文件，获取CO2生成的序号

Returns

tuple:

no_pre_ads_atoms

清理反应中心附近吸附物后的结构原子对象

target_atom_list

目标原子列表

neb_traj_file

neb 优化轨迹文件路径

co2_indexes

CO2生成的序号列表