Module dcg_sci_tool.reaction.construct_final_state

Functions

def construct_final_state(minimized_is_path, target_atom_list)

在自动截取MD轨迹的算能垒的自动化流程中，构建末态结构

Args

minimized_is_path : Path

最小化后的结构文件路径

target_atom_list : list

目标原子列表

Returns

tuple

包含末态结构对象和文件路径的元组

atoms_fs (ASE atoms object): 末态结构对象 fs_path (Path): 末态结构文件路径