Module dcg_sci_tool.structures_modifying.pre_del_gases

Functions

def pre_del_gases(input_file: str, old_indexes_to_transfer: list)

将轨迹文件第一帧结构中，PdAu团簇上游离的气态分子删去，输出新的Atoms对象以及新的原子索引

Args

input_file : str

要处理的轨迹文件地址

old_indexes_to_transfer : list

要获得新索引列表的旧索引的列表

Returns

tuple

处理后的结果

filtered_atoms (Atoms): 处理后的Atoms对象

tranfered_indexes (list): 转化后的原子索引列表